RFID的大规模应用过程中也存在着诸多问题。居高不下的成本，是RFID实现规模应用的最大障碍；技术上某些验证机制的缺乏带来隐私泄漏的担忧；技术标准之争，也是RFID的市场化进程受阻的一个重要原因。

　　价格是RFID走向大规模市场应用的最大障碍。RFID标签的成本一直居高不下，目前一个RFID标签的价格大概在25到30美分左右。这如果是对于集装箱或者汽车、冰箱之类的大宗货物来说，当然算不上什么；但如果是相对于小宗商品来讲，这一价格必然会遭到成本上的质疑。虽然Alien公司宣称，标签的价格会随着订单的增加、生产工艺的提高逐渐下降的。只要年生产量在100亿个以上，单个标签的成本就可以降到10美分甚至更低。但对大多数企业来说，单位成本需要降至3美分或更少才有可能将标签应用于单件包装消费品；另一个方面，布置RFID其他相关设备，如RF信号发射机、信号接收机、编程器、天线等也需要一笔巨大的投入。

　　RFID在技术上也有一定的缺陷。这表现在RFID标签无法对阅读器进行身份验证。RFID标签一旦接近RF扫描器，就会无条件自动发出信号，无法辨别其扫描器是否合法。这意味着如果有人携带一个RF扫描器上街，那么路上行人购物袋里的东西将会“一览无遗”，这将会带来极大的个人隐私保护问题。不过，这一担忧随着众多软件巨头的加盟已经有了较为妥善的解决方案。有报道称，日本印刷、NTT和Sun三家公司已经成功地开发出具有隐私保护功能的无线IC标签系统，其原理是在标签中嵌入加密ID，即便有人读取到ID，也不会知道是什么商品。

　　另外，是统一的技术标准带来的担忧。目前RFID存在两个技术标准阵营，MITAuto-IDCenter与日本的UbiquitousIDCenter分别提出各自不同的基础协议。而这两大阵营中，都有不同的厂商支持。采取何种标准，势必会影响各个厂商的市场份额，进而影响产业链的积极互动合作。在RFID的规模应用中，如何协调各个厂商的利益，如何将分裂的“各路诸侯”纳入到统一的技术规范中，这恐怕要比解决单纯的技术规范问题复杂得多。

        市场调研机构ABI公司最新市场研究报告显示，RFID的发展前景良好，未来五年将稳步增长。ABI公司市场主任MichaelLiard表示：“我们预期2014年RFID市场总体会超过82.5亿美元，用于汽车immobilization(汽车防盗等)约74.6亿美元。这意味着未来五年中年复合增长率为14%，而今年RFID市场也将达到44.7亿美元。”

　　报告显示，RFID"现代化"应用的增长速度将比"传统"的应用快。"传统"的应用包括门禁管理、汽车immobilization、电子收费等，今天约占总市场的61%。在2010到2014年期间，这些应用的年复合增长率预计为6%。与之相比，这些"现代化"的应用，包括动物识别、资产管理、行李处理、货物跟踪与安全、POS无接触支付、RTLS、供应链管理和售票等，预计同期约增长19%。

　　在RFID应用中，汽车immobilization是RFID最大的应用项目，增长率低，对总的市场有影响，所以在审视市场发展趋势时常将其除外。

　　Liard说："RFID市场各部门的发展是不均衡的。到2014年，增长率最高的将是RTLS(实时定位系统)、行李处理、动物识别和服装、零售单件贴标签。"

　　其他主要的机会有电子车辆登记、继续推广的电子身份识别和电子政府证件(包括健康卡)，以及继续推广的图书馆系统。还可以看到增长的有：继续缓慢增长的CPG零售供应链管理和各种撬动RFID技术的资产管理，包括专业无源UHF标签。